De geschiedenis van Transport Desmet-Naert begint tijdens de Tweede Wereldoorlog. Dhr. Desmet richtte Transport Desmet op met twee vrachtwagens. Eén werd door de bezetter geconfisqueerd, de andere wist hij te redden door de wielen te demonteren.

Na de oorlog kreeg de platte vrachtwagen een tweede leven. Op zondagen werd hij omgebouwd met banken voor uitstapjes met de plaatselijke bevolking.

In de jaren zestig nam zoon Ghislain Desmet het roer over. Een van zijn vaste klanten was Dumont-Wyckhuyse, een vlas- en juteweverij in de Mandellaan te Roeselare. Desmet was de hoofdtransporteur en reed zeer frequent richting Luxemburg. Dat was toen nog een rit van meerdere dagen.

Toen de weverij overschakelde van vlas en jute naar kunststof, ging Transport Desmet mee. De fabriek verhuisde naar de Wijnendalestraat, waar ook schuimblokken werden geproduceerd. In de jaren zeventig werden deze blokken vervoerd met standaardopleggers met plaats voor twaalf stuks.

Begin jaren tachtig volgde een belangrijke innovatie: de eerste persoplegger. Het dak kon vier meter omhoog, zodat de schuimblokken konden worden gestapeld en samengeperst tot 120 m³ per rit.

Samen met zijn echtgenote Simonne Naert bouwde Ghislain het familiebedrijf verder uit, van eenmanszaak tot bvba en later NV Transport Desmet-Naert. Een nieuwe naam, dezelfde waarden.

In de jaren negentig nam Dhr. Behaeghel de leiding over. Het bedrijf groeide met moderne perswagens van 180 m³ en een vloot van elf trekkers.

In 2008 kwam Dhr. Huyvaert aan het roer. Onder zijn leiding breidde de onderneming verder uit, met nieuwe klanten, meer vrachtwagens en perswagens tot 300 m³ capaciteit.

In 2010 verhuisde Transport Desmet-Naert naar de Regina Wautersweg in Roeselare.

In 2015 volgde de overname van Transport Verackx, gespecialiseerd in cementtransport. Een nieuwe markt en een volgende stap in de ontwikkeling van het bedrijf.